取卵对身体危害比较小，但不是绝对的，部分女性在取卵过程中可能会损伤邻近器官、盆腔感染或出血、卵巢过度刺激综合征等危害。
目前临床上的取卵技术已经比较成熟，取卵时间比较短暂，去正规医疗机构取卵，有严格且规范的标准，会控制卵子生长的数目，进一步减少并发症的风险，对身体的危害比较小。
医生在取卵过程中可能会损伤邻近器官，比如女性的卵巢位于膀胱下，穿刺经过膀胱且操作不当会损伤膀胱，引起血尿。卵巢粘连子宫后壁，取卵时经过子宫，可能诱发子宫收缩，引起小腹疼痛不适。
医生使用取卵针通过患者阴道进入盆腔，可能会把阴道中的细菌带入盆腔，增加盆腔感染的几率。穿刺到阴道壁血管丛，可能会引起盆腔出血。
使用促排卵药物导致大量卵泡发育，HCG注射促卵子成熟后可能出现卵巢增大、血管通透性增、异常体液外渗入第三间隙等并发症，就是卵巢过度刺激综合征，可能会出现腹部胀满、大量腹腔积液、电解质紊乱等症状，危害比较大。
要去正规的医院取卵，取卵后有不适症状及时就诊。